《温疫论》明代吴又可撰于崇祯十五年壬午（1642年），分上下两卷。吴又可在《温疫论》中创立了“戾气”病因学说，强调温疫与伤寒完全不同，明确指出“夫温疫之为病，非风、非寒、非暑、非湿，乃天地间别有一种异气所感”。这种异气，吴氏为之命名为“戾气”。戾气侵入人体的途径是自口鼻而入。传播的方式有两种：有天受——通过自然环境而感染；有传染——通过接触患者而感染。此二者只是传播方式的不同，但只要感染的是同一种戾气，那么“所感虽殊，其病则一”。戾气具有多样——为病各种、特适——某气专人某脏腑经络专发为某病、偏中——其气各异、所伤不同等特点，同时还具有传染与流行的特点。他的这种设想是具有超前意识的科学设想。并且创立了表里九传辨证论治思维模式，这一辨证模式是围绕“驱邪外出”这样一个中心展开的。吴氏认为伤寒中脉络，因表入里，而温疫之气从口鼻而入，初起则邪伏膜原，在不表不里之间。创制达原饮以疏利膜原，溃散邪气。邪溃之后，可能出表，越于三经，可汗而已；也可能达里，内传于胃，可下而解。治疗上的特点是“注意逐邪勿拘结粪”“下不厌早”“下不以数计”，应根据邪正虚实的情况酌情论治。
《温疫论》是中医温病学发展史上具有划时代意义的标志性著作，其中医理论原创思维与临证实用新法，对后世温病学的形成与发展产生了深远影响。
